Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms