Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC181Q5TID7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC181Q5TID7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms