Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM23BQ5SRD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 471.9 ms