Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms