Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDK2Q58EX2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms