Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP5B1Q2VPB7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms