Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP2Q16527 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP2Q16527 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP2Q16527 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms