Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EXT1Q16394 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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