Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 COPA-205ENST00000541366 616 ntTSL 214.46□□□□□ -0.097e-14■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 COPA-206ENST00000545266 574 ntTSL 25.94□□□□□ -1.467e-14■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 SPTAN1-217ENST00000629089 1546 ntTSL 221.89■■□□□ 1.098e-7■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 UGDH-210ENST00000514106 568 ntTSL 419.77■□□□□ 0.764e-12■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 COPG1-210ENST00000515725 3231 ntTSL 211.23□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -13e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 PGM1-201ENST00000371083 2657 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 APEX1-203ENST00000438886 451 ntTSL 310.52□□□□□ -0.731e-8■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 VCP-205ENST00000479300 559 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.14e-11■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 GOLGA2-214ENST00000611957 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 IMPDH2-202ENST00000429182 1469 ntTSL 515.38■□□□□ 0.057e-7■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.127e-7■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 CKB-212ENST00000555366 419 ntTSL 215.57■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 SPTAN1-238ENST00000637903 574 ntTSL 510.14□□□□□ -0.791e-7■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 DAXX-210ENST00000490173 641 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.854e-6■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 SPTAN1-213ENST00000627809 342 ntTSL 39.96□□□□□ -0.827e-20■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 HUWE1-207ENST00000468322 729 ntTSL 29.99□□□□□ -0.812e-8■■■■□ 19.4
G3BP1Q13283 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 511.8□□□□□ -0.521e-8■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.161e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 SUCLG1-202ENST00000430989 571 ntTSL 415.53■□□□□ 0.089e-10■■■■□ 19.3
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G3BP1Q13283 SUCLG1-203ENST00000442240 568 ntTSL 514.66□□□□□ -0.069e-10■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 19.3
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G3BP1Q13283 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 19.3
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G3BP1Q13283 UROD-207ENST00000462688 901 ntTSL 515.41■□□□□ 0.065e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 UROD-213ENST00000473012 632 ntTSL 315.39■□□□□ 0.055e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 UROD-203ENST00000434478 600 ntTSL 313.96□□□□□ -0.175e-6■■■■□ 19.3
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G3BP1Q13283 UROD-217ENST00000491300 884 ntTSL 513.7□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 UROD-216ENST00000490385 860 ntTSL 512.68□□□□□ -0.385e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 UROD-204ENST00000460334 663 ntTSL 511.47□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 511.59□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 SEC13-218ENST00000490283 740 ntTSL 221.6■■□□□ 1.053e-11■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 SEC13-214ENST00000476597 614 ntTSL 213.36□□□□□ -0.273e-11■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.111e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 11e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 PRMT5-214ENST00000553915 1931 ntTSL 218.46■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 CCT2-214ENST00000553169 758 ntTSL 29.64□□□□□ -0.879e-8■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 CNDP2-226ENST00000584581 4523 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 25.83□□□□□ -1.489e-15■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 IPO5-213ENST00000479736 668 ntTSL 24.88□□□□□ -1.639e-15■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 IPO5-226ENST00000493492 474 ntTSL 34.4□□□□□ -1.719e-15■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 ADD1-221ENST00000536078 423 ntTSL 214.19□□□□□ -0.145e-7■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 VPS35-203ENST00000562420 740 ntTSL 23.67□□□□□ -1.827e-7■■■■□ 19.3
G3BP1Q13283 ADH5-211ENST00000512659 822 ntTSL 513.36□□□□□ -0.276e-8■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 ADH5-204ENST00000503130 786 ntTSL 312.12□□□□□ -0.476e-8■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 ADH5-208ENST00000508511 1909 ntTSL 211.35□□□□□ -0.596e-8■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 PSMB2-203ENST00000630477 1127 ntTSL 1 (best)12.04□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 EFTUD2-225ENST00000593072 551 ntTSL 57.78□□□□□ -1.164e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.47■■□□□ 1.031e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 216.45■□□□□ 0.222e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.012e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 214.2□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 NDUFS1-206ENST00000454195 569 ntTSL 415.26■□□□□ 0.033e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 DDX1-205ENST00000470674 556 ntTSL 25.48□□□□□ -1.534e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CCT7-203ENST00000399032 593 ntTSL 424.09■■□□□ 1.453e-12■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 EFTUD2-204ENST00000585794 578 ntTSL 211.02□□□□□ -0.653e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 ANXA4-209ENST00000477632 3949 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.722e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.354e-6■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CTNNB1-214ENST00000485265 835 ntTSL 24.67□□□□□ -1.661e-9■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 CCT7-205ENST00000461290 1018 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-12■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 215.8■□□□□ 0.124e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.174e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 19.2
G3BP1Q13283 DIAPH1-214ENST00000524301 561 ntTSL 44.5□□□□□ -1.691e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 ANXA4-210ENST00000484219 338 ntTSL 56.65□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.221e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 PHGDH-214ENST00000641314 1558 nt21.77■■□□□ 1.087e-7■■■□□ 19.1
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