RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536078.1

ADD1-221, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 2

Gene ADD1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-221ENST00000536078 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.59■■■□□ 2.17
ADD1-221ENST00000536078 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.59■■□□□ 1.69
ADD1-221ENST00000536078 ABCC9O60706 1549 aa25.49■■□□□ 1.67
ADD1-221ENST00000536078 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.32■■□□□ 1.48
ADD1-221ENST00000536078 NACADO15069 1562 aa24.18■■□□□ 1.46
ADD1-221ENST00000536078 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.1■■□□□ 1.45
ADD1-221ENST00000536078 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.89■■□□□ 1.41
ADD1-221ENST00000536078 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.83■■□□□ 1.41
ADD1-221ENST00000536078 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
ADD1-221ENST00000536078 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.74■■□□□ 1.39
ADD1-221ENST00000536078 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
ADD1-221ENST00000536078 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.63■■□□□ 1.37
ADD1-221ENST00000536078 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.6■■□□□ 1.37
ADD1-221ENST00000536078 SCRIBQ14160 1630 aa23.33■■□□□ 1.33
ADD1-221ENST00000536078 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.3■■□□□ 1.32
ADD1-221ENST00000536078 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.03■■□□□ 1.28
ADD1-221ENST00000536078 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ADD1-221ENST00000536078 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.96■■□□□ 1.27
ADD1-221ENST00000536078 NCAPD3P42695 1498 aa22.33■■□□□ 1.16
ADD1-221ENST00000536078 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.28■■□□□ 1.16
ADD1-221ENST00000536078 SMARCA4P51532 1647 aa22.28■■□□□ 1.16
ADD1-221ENST00000536078 SMARCA2P51531 1590 aa22.21■■□□□ 1.15
ADD1-221ENST00000536078 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ADD1-221ENST00000536078 HMGXB3Q12766 1538 aa22.16■■□□□ 1.14
ADD1-221ENST00000536078 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ADD1-221ENST00000536078 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.06■■□□□ 1.12
ADD1-221ENST00000536078 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.04■■□□□ 1.12
ADD1-221ENST00000536078 ERCC6Q03468 1493 aa22.01■■□□□ 1.11
ADD1-221ENST00000536078 CUX2O14529 1486 aa21.93■■□□□ 1.1
ADD1-221ENST00000536078 NESP48681 1621 aa21.93■■□□□ 1.1
ADD1-221ENST00000536078 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.8■■□□□ 1.08
ADD1-221ENST00000536078 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.79■■□□□ 1.08
ADD1-221ENST00000536078 WIZO95785 1651 aa21.76■■□□□ 1.07
ADD1-221ENST00000536078 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.68■■□□□ 1.06
ADD1-221ENST00000536078 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
ADD1-221ENST00000536078 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.66■■□□□ 1.06
ADD1-221ENST00000536078 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.64■■□□□ 1.05
ADD1-221ENST00000536078 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ADD1-221ENST00000536078 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ADD1-221ENST00000536078 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.48■■□□□ 1.03
ADD1-221ENST00000536078 CFTRP13569 1480 aa21.44■■□□□ 1.02
ADD1-221ENST00000536078 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.42■■□□□ 1.02
ADD1-221ENST00000536078 WDR62O43379 1518 aa21.41■■□□□ 1.02
ADD1-221ENST00000536078 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.41■■□□□ 1.02
ADD1-221ENST00000536078 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.27■■□□□ 1
ADD1-221ENST00000536078 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
ADD1-221ENST00000536078 PRDM2Q13029 1718 aa21.2■□□□□ 0.98
ADD1-221ENST00000536078 TOPBP1Q92547 1522 aa21.01■□□□□ 0.95
ADD1-221ENST00000536078 IFT140Q96RY7 1462 aa20.99■□□□□ 0.95
ADD1-221ENST00000536078 ABCC8Q09428 1581 aa20.98■□□□□ 0.95
ADD1-221ENST00000536078 OSCARQ8IYS5 282 aa20.96■□□□□ 0.95
ADD1-221ENST00000536078 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ADD1-221ENST00000536078 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.94■□□□□ 0.94
ADD1-221ENST00000536078 TRIM41Q8WV44 630 aa20.89■□□□□ 0.93
ADD1-221ENST00000536078 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ADD1-221ENST00000536078 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ADD1-221ENST00000536078 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
ADD1-221ENST00000536078 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
ADD1-221ENST00000536078 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ADD1-221ENST00000536078 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.74■□□□□ 0.91
ADD1-221ENST00000536078 SOGA1O94964 1423 aa20.73■□□□□ 0.91
ADD1-221ENST00000536078 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.69■□□□□ 0.9
ADD1-221ENST00000536078 CUX1P39880 1505 aa20.69■□□□□ 0.9
ADD1-221ENST00000536078 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
ADD1-221ENST00000536078 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.65■□□□□ 0.9
ADD1-221ENST00000536078 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.65■□□□□ 0.9
ADD1-221ENST00000536078 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.65■□□□□ 0.9
ADD1-221ENST00000536078 CHD1O14646 1710 aa20.63■□□□□ 0.89
ADD1-221ENST00000536078 FBLN2P98095 1184 aa20.62■□□□□ 0.89
ADD1-221ENST00000536078 WDR97A6NE52 1622 aa20.61■□□□□ 0.89
ADD1-221ENST00000536078 ARHGEF11O15085 1522 aa20.6■□□□□ 0.89
ADD1-221ENST00000536078 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.56■□□□□ 0.88
ADD1-221ENST00000536078 GRIN2BQ13224 1484 aa20.53■□□□□ 0.88
ADD1-221ENST00000536078 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ADD1-221ENST00000536078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ADD1-221ENST00000536078 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.47■□□□□ 0.87
ADD1-221ENST00000536078 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.47■□□□□ 0.87
ADD1-221ENST00000536078 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.46■□□□□ 0.87
ADD1-221ENST00000536078 SYNJ2O15056 1496 aa20.44■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 PBRM1Q86U86 1689 aa20.43■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.42■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 SYNJ1O43426 1573 aa20.42■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.42■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 ARAP1Q96P48 1450 aa20.41■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 TOP2BQ02880 1626 aa20.39■□□□□ 0.86
ADD1-221ENST00000536078 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.38■□□□□ 0.85
ADD1-221ENST00000536078 GRIN2AQ12879 1464 aa20.26■□□□□ 0.83
ADD1-221ENST00000536078 ADAMTS12P58397 1594 aa20.25■□□□□ 0.83
ADD1-221ENST00000536078 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.22■□□□□ 0.83
ADD1-221ENST00000536078 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.22■□□□□ 0.83
ADD1-221ENST00000536078 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ADD1-221ENST00000536078 NUP160Q12769 1436 aa20.19■□□□□ 0.82
ADD1-221ENST00000536078 CEP170Q5SW79 1584 aa20.18■□□□□ 0.82
ADD1-221ENST00000536078 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.11■□□□□ 0.81
ADD1-221ENST00000536078 SHROOM2Q13796 1616 aa20.07■□□□□ 0.8
ADD1-221ENST00000536078 KIF27Q86VH2 1401 aa20.01■□□□□ 0.79
ADD1-221ENST00000536078 JPH4Q96JJ6 628 aa20■□□□□ 0.79
ADD1-221ENST00000536078 IGF1RP08069 1367 aa19.99■□□□□ 0.79
ADD1-221ENST00000536078 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 274.7 ms