Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF5Q13243 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF5Q13243 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms