Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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