Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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GTF3C1Q12789 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GTF3C1Q12789 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GTF3C1Q12789 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GTF3C1Q12789 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GTF3C1Q12789 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C1Q12789 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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