Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms