Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 SMF3YLR034C 1422 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 ARN2YHL047C 1863 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 HRP1YOL123W 1605 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 RTT103YDR289C 1230 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 IRC7YFR055W 1023 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 NQM1YGR043C 1002 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 VMA16YHR026W 642 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 COS9YKL219W 1224 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 SSP120YLR250W 705 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 YDL119CYDL119C 924 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 CAD1YDR423C 1230 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 CBP4YGR174C 513 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 MND2YIR025W 1107 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 YOR200WYOR200W 399 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 MRPL36YBR122C 534 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 GEP3YOR205C 1671 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 YIR007WYIR007W 2295 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 AFT1YGL071W 2073 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 RPT6YGL048C 1218 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 EGD2YHR193C 525 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 DCN1YLR128W 810 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 SSZ1YHR064C 1617 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.47□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 NGL2YMR285C 1548 nt5.47□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 CST6YIL036W 1764 nt5.47□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 FOL1YNL256W 2475 nt5.47□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 TAX4YJL083W 1815 nt5.46□□□□□ -1.53
CUE5Q08412 CLB4YLR210W 1383 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 HST4YDR191W 1113 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SNN1YNL086W 309 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 PDC1YLR044C 1692 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 ROG3YFR022W 2202 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 GIR2YDR152W 798 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 PHM8YER037W 966 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 YKR041WYKR041W 753 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 NRM1YNR009W 750 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 DBP9YLR276C 1785 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SLD2YKL108W 1362 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 CAB4YGR277C 918 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 ECM1YAL059W 639 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 TFS1YLR178C 660 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 BRF1YGR246C 1791 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 DPH2YKL191W 1605 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SUM1YDR310C 3189 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 GCS1YDL226C 1059 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SCW4YGR279C 1161 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 TOM40YMR203W 1164 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 LEM3YNL323W 1245 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 UBA1YKL210W 3075 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SIS2YKR072C 1689 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 CDC19YAL038W 1503 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 CDS1YBR029C 1374 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 MCM4YPR019W 2802 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 UBP7YIL156W 3216 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 RRT7YLL030C 342 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 MAC1YMR021C 1254 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SPS18YNL204C 903 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 DAL82YNL314W 768 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 ROX3YBL093C 663 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 QDR1YIL120W 1692 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 MRE11YMR224C 2079 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 YAP1801YHR161C 1914 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 MTF2YDL044C 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 RPT4YOR259C 1314 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 APL6YGR261C 2430 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 RGT1YKL038W 3513 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SNF3YDL194W 2655 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SDA1YGR245C 2304 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 RAT1YOR048C 3021 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 SYF2YGR129W 648 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 COS6YGR295C 1146 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 RPS19BYNL302C 435 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 GPM3YOL056W 912 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 CAR1YPL111W 1002 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 RTT106YNL206C 1368 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 ULA1YPL003W 1389 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 YEL077CYEL077C 3834 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 NTH2YBR001C 2343 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 FPK1YNR047W 2682 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 BUD14YAR014C 2130 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 TAF11YML015C 1041 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 ARO7YPR060C 771 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE5Q08412 YLR296WYLR296W 327 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 OSW5YMR148W 447 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 HEM15YOR176W 1182 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 VTC2YFL004W 2487 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 TUP1YCR084C 2142 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 KIP2YPL155C 2121 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 IML2YJL082W 2196 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 TOS4YLR183C 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 YFL034WYFL034W 3222 nt5.38□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 IPI1YHR085W 1005 nt5.38□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 MTW1YAL034W-A 870 nt5.38□□□□□ -1.55
CUE5Q08412 CSR1YLR380W 1227 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.4 ms