Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARDQ03181 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARDQ03181 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms