Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA5Q01523 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA5Q01523 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms