Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD83Q01151 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD83Q01151 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD83Q01151 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD83Q01151 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD83Q01151 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD83Q01151 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD83Q01151 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD83Q01151 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD83Q01151 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD83Q01151 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD83Q01151 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD83Q01151 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD83Q01151 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD83Q01151 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD83Q01151 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD83Q01151 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD83Q01151 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD83Q01151 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD83Q01151 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD83Q01151 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD83Q01151 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD83Q01151 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD83Q01151 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD83Q01151 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD83Q01151 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD83Q01151 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD83Q01151 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD83Q01151 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD83Q01151 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD83Q01151 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD83Q01151 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD83Q01151 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD83Q01151 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD83Q01151 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD83Q01151 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD83Q01151 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD83Q01151 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306 ms