Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP2R2BQ00005 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms