Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113P62684 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERVK_113P62684 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms