Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP4P57723 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms