Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIF1P55008 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIF1P55008 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIF1P55008 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIF1P55008 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIF1P55008 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AIF1P55008 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AIF1P55008 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AIF1P55008 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AIF1P55008 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AIF1P55008 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AIF1P55008 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AIF1P55008 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AIF1P55008 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AIF1P55008 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AIF1P55008 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AIF1P55008 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AIF1P55008 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AIF1P55008 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AIF1P55008 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AIF1P55008 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AIF1P55008 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIF1P55008 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AIF1P55008 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIF1P55008 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIF1P55008 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AIF1P55008 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AIF1P55008 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AIF1P55008 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIF1P55008 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIF1P55008 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIF1P55008 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIF1P55008 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIF1P55008 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AIF1P55008 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIF1P55008 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AIF1P55008 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIF1P55008 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIF1P55008 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIF1P55008 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIF1P55008 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIF1P55008 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIF1P55008 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIF1P55008 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIF1P55008 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIF1P55008 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms