Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC2P49815 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC2P49815 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC2P49815 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC2P49815 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC2P49815 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC2P49815 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC2P49815 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC2P49815 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC2P49815 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC2P49815 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC2P49815 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC2P49815 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC2P49815 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC2P49815 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC2P49815 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC2P49815 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC2P49815 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC2P49815 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC2P49815 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC2P49815 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC2P49815 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC2P49815 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC2P49815 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC2P49815 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSC2P49815 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC2P49815 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC2P49815 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC2P49815 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC2P49815 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC2P49815 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC2P49815 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms