Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOP2P46087 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOP2P46087 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP2P46087 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP2P46087 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP2P46087 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP2P46087 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP2P46087 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP2P46087 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP2P46087 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP2P46087 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP2P46087 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP2P46087 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP2P46087 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP2P46087 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP2P46087 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOP2P46087 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOP2P46087 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOP2P46087 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP2P46087 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP2P46087 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP2P46087 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP2P46087 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOP2P46087 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOP2P46087 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOP2P46087 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOP2P46087 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NOP2P46087 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NOP2P46087 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOP2P46087 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP2P46087 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP2P46087 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP2P46087 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP2P46087 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP2P46087 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP2P46087 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP2P46087 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP2P46087 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP2P46087 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP2P46087 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP2P46087 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP2P46087 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP2P46087 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP2P46087 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP2P46087 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP2P46087 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP2P46087 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP2P46087 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms