Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMC4P43686 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC4P43686 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC4P43686 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC4P43686 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC4P43686 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC4P43686 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC4P43686 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC4P43686 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC4P43686 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms