Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR1BP42025 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTR1BP42025 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms