Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX6P30041 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDX6P30041 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDX6P30041 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms