Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD10P28358 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD10P28358 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms