Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SSFA2P28290 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSFA2P28290 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms