Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB1P20618 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB1P20618 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms