Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN8P19075 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms