Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFXP16104 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFXP16104 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms