Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL2P13500 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL2P13500 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL2P13500 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL2P13500 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL2P13500 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL2P13500 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL2P13500 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL2P13500 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL2P13500 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL2P13500 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL2P13500 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL2P13500 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL2P13500 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL2P13500 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL2P13500 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL2P13500 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL2P13500 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL2P13500 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL2P13500 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL2P13500 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL2P13500 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL2P13500 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCL2P13500 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL2P13500 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL2P13500 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL2P13500 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL2P13500 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL2P13500 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL2P13500 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL2P13500 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL2P13500 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms