Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM1P13164 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms