Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK1P06493 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK1P06493 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK1P06493 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK1P06493 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK1P06493 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK1P06493 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK1P06493 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK1P06493 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK1P06493 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK1P06493 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK1P06493 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK1P06493 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK1P06493 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK1P06493 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK1P06493 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK1P06493 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK1P06493 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK1P06493 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK1P06493 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK1P06493 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK1P06493 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK1P06493 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK1P06493 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK1P06493 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK1P06493 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK1P06493 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK1P06493 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK1P06493 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK1P06493 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK1P06493 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK1P06493 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK1P06493 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK1P06493 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK1P06493 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK1P06493 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK1P06493 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK1P06493 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK1P06493 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK1P06493 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK1P06493 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK1P06493 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms