Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1P04632 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1P04632 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1P04632 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms