Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED1O96006 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
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