Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTXRO95502 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTXRO95502 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms