Protein–RNA interactions for Protein: O94911

ABCA8, ATP-binding cassette sub-family A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA8O94911 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ABCA8O94911 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCA8O94911 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCA8O94911 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCA8O94911 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms