Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBXN7O94888 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms