Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40AO75400 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40AO75400 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms