Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NPHP4O75161 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NPHP4O75161 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NPHP4O75161 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms