Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDF1O60869 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDF1O60869 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDF1O60869 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDF1O60869 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDF1O60869 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDF1O60869 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDF1O60869 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDF1O60869 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDF1O60869 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDF1O60869 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDF1O60869 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDF1O60869 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDF1O60869 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDF1O60869 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDF1O60869 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDF1O60869 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDF1O60869 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDF1O60869 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDF1O60869 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDF1O60869 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDF1O60869 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDF1O60869 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDF1O60869 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDF1O60869 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDF1O60869 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms