Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNCRIPO60506 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNCRIPO60506 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms