Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC11O43248 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms