Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms