Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PQ18 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PQ18 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PQ18 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PQ18 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PQ18 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PQ18 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PQ18 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PQ18 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PQ18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PQ18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PQ18 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PQ18 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PQ18 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PQ18 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PQ18 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PQ18 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PQ18 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PQ18 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PQ18 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PQ18 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PQ18 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PQ18 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PQ18 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PQ18 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PQ18 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PQ18 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PQ18 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PQ18 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PQ18 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PQ18 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PQ18 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms