Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMG1C9JSJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHMG1C9JSJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms