Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM3A6NDB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms