Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms